一个开源人类基因组数据库的想法
xjp132014/08/11生物学 IP:四川
本帖最后由 xjp13 于 2014-8-11 18:33 编辑

         现在越来越多的行业将知识”傻瓜化“,方便越来越多的人使用,受此启发,我们想整理出一个人类基因组开源数据库,这里需要解释一下,人类的基因组数据本身是开放的,任何人都可以查询,但像NCBI,UCSC,OMIM这样的专业数据库是供科研人员查询使用,对数据库如果不熟悉完全看不懂。我们想构建的这个数据库是从这些专业的数据库里整理出人类基因的相关数据信息,然后用一些比较傻瓜化的查询方式,争取在完全没有生物信息学基础的情况下,让普通人5分钟学会查询人类基因数据。带动广大生物GEEK开始玩转基因。对社会科普也有很大好处。随着目前测序成本的急速下降,预计5年左右可降到1000元(目前1万元左右),也就是说5年内大家可以花千元拿到自己的基因组数据,那么届时将有庞大的数据分析。大家看看有什么想法,可以提出来讨论。
        补充:一个人的基因组数据大概30亿字节,也就是3G左右。压缩包可压缩到800M左右。需要的联系我,我发给你一份

基因组压缩包.jpg
      应大家要求,我把压缩包上传到网盘:XXXXXXXXXXXXXXXXXXXX/s/1dDksWId         fa文件用UltraEdit就可打开。压缩包里是每条染色体的小压缩包,可以单独解压每一条染色体的,建议解压小点的先看看。

+30  科创币    发电机    2014/08/11 感谢分享
+1  学术分    虎哥    2014/09/14 本帖符合加学术分的标准,鼓励!
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~~空空如也
虎哥
9年8个月前 IP:未同步
715726
这东西结合大数据(尽管我也没搞明白这是什么),应该可以很牛逼的,关键问题是中间的工具链建设,要搞得跟玩arduino一样容易,一千万人没事就折腾,就会有许多新进展的。
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xjp13作者
9年8个月前 IP:未同步
715747
虎哥 发表于 2014-8-25 23:53
这东西结合大数据(尽管我也没搞明白这是什么),应该可以很牛逼的,关键问题是中间的工具链建设,要搞得跟 ...


是的,虎哥,我们的想法就是要搞得和arduino一样容易,五分钟上手是目标![s:12]
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冷血
5年5个月前 IP:新疆
852066

方便给我传一份。79646694@qq。com。我们这打不开网盘

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张静茹
5年5个月前 修改于 5年5个月前 IP:江苏
852068

楼主言中了 这才不到五年 就几百块了,

3GB能压缩到800M  人类基因重复冗余的好多呀

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虎哥
5年5个月前 IP:四川
852069
引用张静茹发表于54楼的内容
楼主言中了 这才不到五年 就几百块了,3GB能压缩到800M  人类基因重复冗余的好多呀

如果做足够深度的测序,还是要上万元,一点都不便宜。几百元的那种纯属忽悠。

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张静茹
5年5个月前 IP:江苏
852102
引用虎哥发表于55楼的内容
如果做足够深度的测序,还是要上万元,一点都不便宜。几百元的那种纯属忽悠。

各色基因那种不靠谱吗?

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BI4LNE
5年5个月前 IP:美国
852153

山寨云网盘限速比较厉害,这800M可能要下到猴年马月

给楼主介绍一个Mozilla实验室项目, XXXXXXXXXXXXXXXX ,上传上去之后任何知道链接的人都能下载,关键是无墙无限速

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