xjp13
百炼成钢
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科创币
2010/10/18注册,22 天前活动
貌似八月瓜!

多谢帮忙排版,[s::)]

这些论文有一定参考价值,把基因组数据类型,格式等详细说明了,里面也列举了一下可视化的实现方式,为大家入门提供些基础资料。 [url]http://pan.baidu.com/s/1sjlsh0x[/url] 基于MVC架构的可重用基因组序列可视化软件 华中科技大学硕士 2004 真核生物基因组结构自动注释系统研究 ...


不是,我们这开放的数据不能用于个人用药和疾病预防,要达到这个目的需要漫长而复杂的临床数据收集和整理,这些数据就是那些公司的核心竞争力,是不公开的,我们这里是科普目的,让大家慢慢接触这个,个人认为未来医疗将处处用到类似的数据,算是打个基础吧!

已经跑题了,我得把话题引回来。以后开个转基因专题,我们目前打算科普人的遗传数据!

参考一下这两本书《酵母遗传学方法实验指南》《转基因技术:原理与实验方案》

我不是专做基因检测的,在朋友公司帮忙分析数据。介绍转基因流程还是评价下它备受争议的现状?

嗯嗯,慢慢会增加趣味性的,现在还只是个开始,大家集思广益!

考虑用人主要是相关信息慢慢会和健康相关,可能就与每一个人相关了,比如医院开始提供的无创产检,就是通过母血中胎儿的游离DNA检测胎儿是否有遗传病,再如某公司最近推出的高血压用药检测芯片,等等。我们科普人的基因知识就是想广大群众中理解基因相关的健康知识。如果做真核单细胞生物,最好就选择酵母,目前对酵母的研究非常详细,合成基因已开始对酵母的多条染色体全合成了,这个模式生物的数据极其详细。

嗯嗯,既然是搞生物的那就一起想看看如何玩比较安逸,不知是否做实验搞烦了,呵呵

有制作的,打算给大家做一个开源的PCR方案,自己动手做PCR

SNP 即单核苷酸多态性,指某个位点的的碱基有多种可能性,不同的可能性可能会导致不同的表型

谢谢![s::lol]

应科创论坛要求现将发起人信息公布一下,以及整个计划的规划: Xjp13 男 30岁 生物工程专业背景,现供职于成都某科技公司,我自己参加过23andme的测序,也在等待全基因组测序价格降到1000元内。 目的:基因知识科普,为广大基因爱好者提供一个入门的平台。未来的医疗服务基因检测将大量运用,掌握一些相关基础知识是很有必要的。 实施:计划是将基于SNPedia的5万多条SNP数据...

[font=宋体] 前段时间发文《[/font][b][backcolor=white][color=#333333][font=宋体]一个开源人类基因组数据库的想法[/font][/color][/backcolor][/b][font=宋体]》[/font][url]https://www.kechuang.org/t/66555[/url][font=宋体]受到大家强烈的回应。通过[...

不错,这个值得称赞,希望玩技术的女孩越来越多!工程师苗子!

是的,虎哥,我们的想法就是要搞得和arduino一样容易,五分钟上手是目标![s:12]

联系测序公司

这个数据来自华大测序的第一个黄种人基因组(炎黄一号),是单独一个人的。M表示线粒体染色体,他是最小的,1万多个序列,所有人都有。你所说的注释我理解是差异位点的描述吧,这个数据是非常庞大的,我大概说说吧,SNP位点(也就是某个核苷酸有多种可能)大概300万个,目前要就远不止这么多,indel位点(就是某些位增加或者缺失了核苷酸),这个大概10多万个,还有些结构变异的。这么多序列的差异引起表型的差...

N是由于测序过程中荧光信号不强而导致测序仪器无法识别该位点碱基的类型,故用N来标注

不得不说很不错,赞一个

刘博士,这个可不可以用来测ZigBee,蓝牙,WiFi这些信号啊?

你想多了,要达到那一步还很遥远,现在有用基因模拟人的颅面发育的研究,也就是模拟长相,才刚刚起步。

这没啥好牛的,现在基因研究很普遍了,民众科普迫在眉睫,我们做出来简单易用的分析工具在说牛吧![s:1]

你的想法很有意思,就是建立在大数据平台上,根据自己的遗传数据去寻找和自己有同样表型的小伙伴,目前还只能通过专门的测序和分析公司来做,比如华大现在搞的地中海贫血检测,他们给地贫患者搭建了交流平台,目前给普通用户的简单易用软件还没有,现有的软件都是专业版的(比如HGMD pro),我开这个贴的目的也就是想收集大家的意见,我们想搞一个开源免费的软件,目的是教大家慢慢学习生物信息分析,科普一下生物信息...

你说的是获得自己的序列吧,那就交给专业的测序公司好了,价格急速下降,预计也就2~3年价格就到1000元了,目前先学会如何分析,有公开的基因组,随便分析,其实我们想搭建的这个平台就是给大家科普玩的,所以尽量做到简单易用,把专业性的东西转化成普通人理解太难了

上面有网盘地址!

我不是华大的,但和华大有合作,做临床应用研究的,以前没有往临床方面发展也是你这样的认为的,后来随着数据挖掘的深入和临床的结合,原来基因组数据可以挖掘出这么多东西,既然你在华大认识不少人,让他们给你推荐华大健康方面的研究吧,并不是所有的华大人都熟悉人的基因组数据挖掘,我认识个华大朋友搞植物基因组的,他对人的数据了解很少。现在华大的人(不是华大官方)刚好在搞一个众筹项目,想必你知道吧,就是花一万给...

[i] 本帖最后由 xjp13 于 2014-8-11 17:53 编辑 [/i] 看来你是行业内的人士,不过了解不够深入,目前测序深度30X价格10000万左右,你要多少我给你做多少,你可知道华大规划的是5年内测序让用户付出的代价可以忽略不计,主要成本就是分析数据,这需要与临床结合。现在早已经展开了,人类基因组分析算是健康产业,所以有巨额资本在追逐,不想你做的微生物,产业推动很快。

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