本帖最后由 718281828kc 于 2014-5-9 10:46 编辑

如果大家有需要。。。
那么还可以发MOPAC2012。。。
就4.2MB大小，是免费软件但不开源，可与Chem3D联用。
序列号可以免费获得。。。
MOPAC2012独家支持PM7算法，是半经验算法精度最高的，还可以解决例如-SO₃Na之类使PM3报错的问题。
利用独家开发的MOZYME方法，可以在仅引入微量可忽略误差的情况下，大大加速运算。
还有DFT-D近似密度泛函方法，在保持高精确度的情况下，成数量级地加速运算。
例如
1. H₂O Box，左图12426原子，右图25095原子，左图PM7 MOZYME 4线程 14.4min，-282616.10434kcal/mol，内存用了1.2GB；
右图PM7 MOZYME 4线程 98.6min，-576587.48001kcal/mol，内存用了4.5GB。

2. ETK蛋白，3944原子
PM7 MOZYME 单线程 323.8/325.5s -16765.64836kcal/mol，用了300MB内存