典型的RO/NF膜系统结构
经过预处理的原水，经过保安过滤器，进入高压泵，加压达到膜系统的设计工作压力，压力从小型家用系统1812膜元件的0.34MPa，至大型海水膜元件6.9MPa不等。
RO/NF元件的天生缺陷，因工作原理限制，无法实现全通量过滤，有产水，就必定有浓水（废水），否则被膜元件阻隔的溶质，逐步在元件的浓水面积累，达到足够的浓度，产生结垢，堵塞元件；膜元件的浓水面，正常工作的情况下，还必须保证厂家设计给出的最低浓水流量，否则无法将已经产生细微沉淀尚未结垢的溶质，有效冲刷排出。
对于非连续运行，脱盐率和元件寿命要求不高的小型商用、家用、实验室用单膜元件系统，允许的最大系统回收率为30~33%，即浓水量：产水量≥2:1，预期元件更换寿命1~3年，采用频繁冲洗（高压泵全开，浓水旁路冲洗开关全开，基本无产水）的措施，防止膜系统结垢堵塞。
浓水控制（调节）阀，调节浓水流量，通常并联冲洗电磁阀，在自动或手动冲洗时，冲洗电磁阀将浓水控制阀旁路全通，使膜元件进水基本全部通过内部浓水面高速流过，对元件进行冲洗。