频率计算前应在相同理论水平下进行结构优化。
另外频率计算没有必要用这么高的理论水平，通常的做法是在 B3LYP/6-31G(d,p)水平进行频率计算，得到热力学能校正（含零点能等）。在更高的理论水平（B3LYP/6-311G(d,p)或MP2等，弥散函数没有必要加）计算优化结构的单点能，加在一起即为该物种的热力学能。
另外频率计算没有必要用这么高的理论水平，通常的做法是在 B3LYP/6-31G(d,p)水平进行频率计算，得到热力学能校正（含零点能等）。在更高的理论水平（B3LYP/6-311G(d,p)或MP2等，弥散函数没有必要加）计算优化结构的单点能，加在一起即为该物种的热力学能。