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玩转个人基因招募小伙伴
2014/10/14
IP:四川
     前段时间发文《一个开源人类基因组数据库的想法》https://www.kechuang.org/t/66555受到大家强烈的回应。通过2个多月的准备,我整理了一些资料分享给大家,让大家零基础玩转个人基因。由于本人空余时间不多,需要招募小伙伴一起整理排版这些资料,届时资料将陆续公布到科创论坛,希望坛主开个专版,可否?哈哈,希望感兴趣的小伙伴踊跃报名哦!成都的小伙伴请注明是本地的,我们空余可以见面交流!
QQ群:78715814
来自:
农林牧渔/农业
27
xjp13作者
12年2个月前IP:四川
726327
1楼
应科创论坛要求现将发起人信息公布一下,以及整个计划的规划:
Xjp13   男   30岁    生物工程专业背景,现供职于成都某科技公司,我自己参加过23andme的测序,也在等待全基因组测序价格降到1000元内。

目的:基因知识科普,为广大基因爱好者提供一个入门的平台。未来的医疗服务基因检测将大量运用,掌握一些相关基础知识是很有必要的。

实施:计划是将基于SNPedia的5万多条SNP数据翻译部分过来(我已经开始翻译),筛选其中好玩的部分给零基础的爱好者参考学习用,并提供样本序列,让大家直观体会基因信息包含的奥秘。并写一个很基础的生物信息软件,将翻译的数据可视化展现出来。
为何选择SNPedia数据库:该数据库结构简单,本身就是科普型的,用户不容易被这种数据类型搞得头晕,里面最主要就是SNP的数据。且该数据库提供了丰富的链接,把他们数据的出处指向了NCBI、HapMap等专业的数据库,为爱好者深入学习提供了支持。
该计划的主要目的是科普基因的相关知识,为大家提供一个了解相关行业的平台。这里可能会有一些趣味性,比如:
喝酒脸红的奥秘,
你对蔬菜的苦味是否敏感,
有人吃香菜觉得肥皂味,
容易近视和肥胖也有遗传原因哦、
干稀耳屎基因决定。
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xjp13作者
12年2个月前IP:四川
726782
6楼
引用 499382569:
顶一下
谢谢![s::lol]
引用
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xjp13作者
12年2个月前IP:四川
726783
7楼
引用 xiaobai152:
SNP。。。
SNP 即单核苷酸多态性,指某个位点的的碱基有多种可能性,不同的可能性可能会导致不同的表型
引用
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xjp13作者
12年2个月前IP:四川
726784
8楼
引用 布布卡:
这个要是不是理解而是去制作就有意思了
有制作的,打算给大家做一个开源的PCR方案,自己动手做PCR
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xjp13作者
12年2个月前IP:四川
726888
10楼
引用 xiaobai152:
我知道啊,表示回复这条前一个小时分子刚讲过
嗯嗯,既然是搞生物的那就一起想看看如何玩比较安逸,不知是否做实验搞烦了,呵呵
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xjp13作者
12年2个月前IP:四川
726952
13楼
引用 justkaka:
楼主为何不从真核单细胞生物做起?
人的基因表达实验好做么?
考虑用人主要是相关信息慢慢会和健康相关,可能就与每一个人相关了,比如医院开始提供的无创产检,就是通过母血中胎儿的游离DNA检测胎儿是否有遗传病,再如某公司最近推出的高血压用药检测芯片,等等。我们科普人的基因知识就是想广大群众中理解基因相关的健康知识。如果做真核单细胞生物,最好就选择酵母,目前对酵母的研究非常详细,合成基因已开始对酵母的多条染色体全合成了,这个模式生物的数据极其详细。
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xjp13作者
12年2个月前IP:四川
726953
14楼
引用 hjs2288:
建议增加趣味性。。。。感觉是片蓝海,很有操作的空间
嗯嗯,慢慢会增加趣味性的,现在还只是个开始,大家集思广益!
引用
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xjp13作者
12年2个月前IP:四川
726978
16楼
引用 justkaka:
你是专做基因检测的,对么?转基因能介绍一下么?
我不是专做基因检测的,在朋友公司帮忙分析数据。介绍转基因流程还是评价下它备受争议的现状?
引用
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xjp13作者
12年2个月前IP:四川
727057
18楼
引用 justkaka:
我没表达清楚。
我看了一些资料,通过质粒,噬菌体,专座子导入外源
基因,进行蛋白质产出表达。
我想了解有没有详细介绍一个物种的具体操作。

例如 面包酵母 第3条染色体,320K bp内
是否可以在任意位置插入任意长度的外源基因。

是否可...
参考一下这两本书《酵母遗传学方法实验指南》《转基因技术:原理与实验方案》
引用
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xjp13作者
12年2个月前IP:四川
727151
21楼
引用 fuwen0202:
转基因,说着高端还是很简单的东西,质粒拼接,转移质粒,然后就是玩概率了。。
已经跑题了,我得把话题引回来。以后开个转基因专题,我们目前打算科普人的遗传数据!
引用
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xjp13作者
12年2个月前IP:四川
727226
23楼
引用 justkaka:
楼主对个人基因简单分析注释,用途是个人用药和疾病预防么?
不是,我们这开放的数据不能用于个人用药和疾病预防,要达到这个目的需要漫长而复杂的临床数据收集和整理,这些数据就是那些公司的核心竞争力,是不公开的,我们这里是科普目的,让大家慢慢接触这个,个人认为未来医疗将处处用到类似的数据,算是打个基础吧!
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我也是有底线的